Datenbank

Interpro

Weitere Titel:
  • Integrated Resource of Protein Families,
  • Daomains and Sites (EMBL-EBI)
  • Protein families database of alignments and HMMs
  • Pfam
  • Classification of protein families
Verfügbarkeit:
frei im Web
Inhalte:
Integriert wichtige sekundäre Datenbanken zuProteinsequenzen und -struktur; ermöglicht damit eineeinfache, simultane Abfrage dieser Datenbanken(Swissprot, TrEMBL, Prosite, Pfam, Prints, ProDom,Smart, TIGRFAMs).
Klassifiziert Proteinfamilien mit Hilfe von Profilen. Basiert auf Sequenz-alignments als Ausgangspunkte zur automatischen Erstellung von Hidden Markov Modellen (HMM)
Fachgebiete:
  • Biologie
  • Chemie
  • Medizin
Schlagwörter:
Proteine, Sequenzanalyse, Proteinstruktur, Klassifizierung
Erscheinungsform:
WWW (Online-Datenbank)
Datenbank-Typ:
Faktendatenbank
  • Faktensammlungen (formal und inhaltlich erschlossene Primärinformationen), z.B. statistische Daten, chemische Formeln, Firmen- und Produktdaten